A Secretaria-Geral do Ministério da Justiça (SGMJ) está organizada internamente em quatro unidades orgânicas principais, uma equipa multidisciplinar de gestão de fundos comunitários e a unidade de compras do Ministério da Justiça.
A SGMJ divide-se em seis áreas funcionais:
- recursos humanos, planeamento e organização
- recursos financeiros, patrimoniais e tecnológicos
- apoio especializado, recursos documentais e relações públicas
- serviços jurídicos e de contencioso
- unidade de compras do Ministério da Justiça
- gestão de fundos comunitários.
Para uma consulta detalhada das competências das várias áreas funcionais (unidades orgânicas) da SGMJ consulte a Portaria n.º 385/2012, de 29 de novembro.